Hace mucho tiempo hubo una gran guerra, llamada la guerra de los Magis en la que se utilizaba mucha magia, pero después de esa guerra, la magia desapareció y ahora nadie la puede usar, es algo desconocido. Pero una chica llamada Terra si que puede usarla, el único inconveniente es que trabaja para el malvado imperio, el cual ha conseguido hacer magia a través de unas maquinas de guerra. Bajo las órdenes de Kefka, Terra junto con dos tropas va a una misión para conseguir un esper congelado que acaban de encontrar, Tritoch, con el cual pretenden crear magia. En esta misión, Terra es liberada y escapa del imperio que la estaba esclavizando. En esta huida conoce a Loke, un cazatesoros. Su primer destino es el castillo de Figaro, donde el rey, Edgar, se une a ellos, el cual forma parte de un grupo que lucha contra el imperio. Pero no por eso se une a ellos, sino también porque tiene debilidad con las mujeres.

A partir de este punto, empieza la verdadera historia, donde conoceremos la verdadera identidad de Terra, se unirán mas personajes y conseguirán el poder de los espers para así vencer al imperio.

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