En esta película, Conan Edogawa viaja a Kyoto para resolver un enigmático y misterioso caso. Se cometen cinco asesinatos en Tokio, Osaka y Kyoto. Kogoro Mouri es contratado para investigar en un templo de Kyoto un caso de robo de una estatua de Buda. Con él viajan Conan, Ran y Sonoko que más tarde se reunirán con Heiji y Kazuha y la liga juvenil de detectives junto con Agasa. En esta historia Heiji Hattori conocerá a su primer amor, una chica que conoció entre los cerezos de Kyoto.
Tras investigar en profundidad el misterioso robo pronto se darán cuenta de que el caso se hará más profundo y más peligroso. ¿Podrán los dos detectives resolver el caso, o caerán bajo la ira de los samurai? ¡Conan está listo para ayudar cuando se encuentren en la encrucijada en la antigua capital!
Noticia procedente de Mision Tokyo